单细胞数据分析

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单细胞数据分析

为了剖析每个细胞的生物学功能，分析单细胞 RNA 测序数据的一个重要步骤是用标记基因对特定细胞类型进行分类。在这项研究中，我们开发了一种称为单细胞预测标记(SPmarker)的机器学习管道...

利用cellranger分析单细胞数据

单细胞分析流程 单细胞的数据处理主要包括 illumina 数据碱基识别，数据质控过滤，生成 feature-count 矩阵等过程。这些过程都可以使用 cellranger 完成。同样也可以使用第三方的 STARsolo，...

分享一个好用的单细胞图谱数据库

今天分享来自同实验室开发的另一个基于小鼠的细胞图谱数据库 MCA（Mouse Cell Atlas），该数据库使用单细胞测序确定了小鼠主要器官的细胞类型组成，并构建了小鼠细胞图谱，我们可轻松调用数据...

单细胞数字定量分析系统

建立在分析细胞本身功能基础上的智能化和便携式的分析系统，可对细胞本身和细胞内外分泌的基因，蛋白等物质进行实时动态分析，通过数学图像扫描进行定量统计，不仅极大地提高灵敏度，同时定量数据更加准确，检测线性范围宽，特异性好，费用低，是未来很有前途的细胞功能定量分析方法。应用方向：核酸检测（肿瘤突变，产前诊断...

单细胞数据分析

介绍单细胞数据分析软件和技巧 单细胞分析流程之RNA velocity（一） 发育轨迹分析是单细胞分析中比较常见的一种分析，旨在预测出细胞类型之间的发育关系，构建细胞的发育轨迹。常见的发育轨迹分析有很多，例如monocle. 0.

单细胞数据分析与可视化的魅力与挑战

单细胞 数据分析 与可视化的魅力与挑战 其实呢，单细胞数据分析与可视化这个话题，最近在生物技术和医学研究圈子里热度飙升。想象一下，你在星巴克喝着咖啡，跟朋友聊起这个话题，感觉就像在讨论最新的电影一样有趣。单细胞数据分析...

单细胞数据

本教程涵盖了使用 hdWGCNA 对单细胞数据执行共表达网络分析的基础知识。在这里，我们使用来自本出版物的人类皮层样本的处理单核 RNA-seq(snRNA-seq)数据集来演示 hdWGCNA。该...

scanpy分析单细胞数据

scanpy和seurat是最常用的分析的单细胞的工具，seurat基于R，而scanpy基于python。linux下用pip安装scanpy代码语言： javascript代码 运行次数： 0运行AI代码解释pip install scanpy下载测...

单细胞数据分析

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