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TCGA数据库
每个样本都有独特的TCGA ID(如TCGA-02-0001),用于跨数据库搜索患者信息。样本编码规则包括组织部位、组分、分子类型、孔板顺序和检测中心等。总的来说,TCGA数据库是一个丰富的癌症研究宝库,为科研人员提供了大量珍贵的癌...
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TCGA数据库简介
基于TCGA等公共数据库的挖掘是目前研究的一个热点,在文章中也经常会使用TCGA的数据来和自己实际的数据相互映证。了解和掌握TCGA数据的用法势在必行,在后续文章中会详细介绍。
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TCGA 数据库培训
学习目标:本次会议提供了一次系统掌握 TCGA 和 SEER 等癌症公共数据库数据结构、挖掘方法及分析流程的机会,目的在于助力有志于利用这些公共数据库的临床医生以及转化研究的科研人员...
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TCGA数据库
首先,我们从TCGA下载甲基化数据和转录组数据,然后分别提取得到甲基化矩阵和转录组矩阵。然后将甲基化数据和转录组数据合并,合并后,我们把满足三个条件的基因,作为甲基化驱动基因。1.基因在...
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TCGA数据库在线使用
本文包括了 TCGA 本站中数据的浏览、下载,尤其是TCGA改版后的功能介绍(增加了 OncoGrid 展示),然后是 cBioPortal,TCGA数据在线提供的分析类型最多的一个平台,再是 FIREBROWSE,比较不错的...
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TCGA数据库讲解与数据下载
TCGA(The cancer genome atlas)是一个非常重要的癌症数据库,其主要收录各种人类癌症(包括亚型在内的肿瘤)的临床数据,基因组变异,mRNA表达,miRNA表达,甲基化等数据,是癌症研究者很重要的...
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TCGA数据库的初次了解
相信你们在看文献的过程中,经常可以看到有些作者利用TCGA数据库里的数据进行分析、整合,得到很多有意思的思路。那么TCGA数...
TCGA数据库
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