探索基因功能的工具箱：功能富集分析及GO与KEGG详解

作为基因本体论联合会的重要成果，GO旨在为各类物种的基因和蛋白功能提供标准化描述。其注释涵盖了分子生物学功能、生物学过程及...

GO与KEGG富集分析

下面做KEGG的富集分析，输入文件的话和GO富集分析是相同的，唯一不同的就是脚本文件。运行脚本文件后，我们同样得到了三个图形和KEGG的结果文件。课程链接： 《TCGA数据库肿瘤微环境视频》 精品...

CEO数据库单基因分析之GO与KEGG的富集分析

我们已经将基因的名字转化为了id，接下来我们就可以做GO的富集分析。通过GO富集分析，我们可以得到柱状图和气泡图，我们这里就讲解一下气泡图，它的纵坐标就是我们GO的名称，然后横坐标就是基因...

go富集分析和pathway信号通路分析

Pathway数据库包括了多个信号通路网络，并提供了大量的生物信息学信息，包括基因本体、蛋白互作、药物靶标、疾病相关基因等。Pathway信号通路分析的主要流程如下： 收集已知的基因集。 将基...

go分析和kegg分析

生物信息学研究中，获取基因列表的GO和KEGG富集分析的需求非常常见。目前有许多生物信息学手段或者数据库可以实现基因富集分析，例如DAVID，但它们有些是收费的，有些不易于使用且很少维护。

原来基因功能富集分析这么简单

GO 功能富集 分析 基因本体论（Gene Ontology，GO）数据库是GO联合会在2000年构建的一个数据库，旨在建立一个适用于各种物种的、对基因和蛋白功能进行限定和描述的，并能随着研究不断深入而更新...

7 基因本体数据库GO及注释.

生物信息学入门 医学专业 生物信息学入门 医学专业 1 生物信息学研究发展. 24:57 3 常用生物医学数据库介绍...7 基因本体数据库GO及注释. 40:40 8 生物学通路KEEG、注释及基因功能富集分析. 28:19

【数据分析】转录组基因的GO term的富集分析详解

GO（Gene Ontology）本体类型是用于描述基因及其产物功能的 标准化 分类体系，包含三个主要的本体类型，每个类型都从不同的角度描述基因产物的生物学特性： 1.分子功能（Molecular Function，MF...

GO功能注释及富集分析

GO（Gene Ontology）是基因本体联合会（Gene Ontology Consortium）所建立的数据库，旨在建立一个适用于各种物种的，对基因...

GO的概念及用R做简单的富集分析

GO(Gene Ontology)富集分析基因本体数据库是一个结构化的标准生物学模型，旨在建立基因及其产物知识的标准词汇体系。举个简单的例子，随机在中国挑出10000个人，这些人会有什么特征呢？如果按照男女划分，可以划分两大类，那如果按...