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我们的云平台上的GO富集分析工具，需要输入的文件表格和参数很简单，但很多同学都不明白其中的原理与结果解读，这个帖子就跟大家详细解释~ 一、GO富集介绍： Gene Ontology（简称GO）是一个国际...

手把手教你看富集分析结果之GO富集

下面我们认识一下GO富集分析的真面目。GO，Gene Ontology，是基因功能国际标准分类体系。它旨在建立一个适用于各种物种的，对基因和蛋白质功能进行限定和描述的，并能随着研究不断深入而更新的...

富集分析GO KEGG GSEA的区别

GO和KEGG是基于不同的分类思想而储存的基因相关功能的数据库,富集分析就是一个把这些功能进行进行整合计算的算法，GO富集，就是研究基因的本质的，从三个层面，分别描述基因的分子功能.

GO富集分析示例

富集分析主要用于差异基因在GO term的富集程度，颜色越深富集越显著，红色最显著，黄色次之，无色代表富集不显著。GO term分为三大类，每一类从不同的层面解释基因的生物学功能，我们可以结合生物学问题的特殊性，有针对性的关注GO...

GO富集分析

GO归类 GO过表现分析(ORA)GO 基因集合富集分析(GSEA)非模型生物的GO分析 可视化GO 1.GO归类 前文提到GO分三种，molecular function(MF),biological process(BP),and cellular component(CC)。在...

使用topGO进行GO富集分析

ontology 指定GO的分类，GO的3大类别 BP,CC,MF 之间是独立，所以GO其实分为3个子 数据库，做富集分析时，不同类别分开做。nodeSize 用于对GO进行过滤，GO最少需要包含10个基因才会对该GO进行...

使用topGO进行GO富集分析

ontology 指定GO的分类，GO的3大类别 BP,CC,MF 之间是独立，所以GO其实分为3个子 数据库，做富集分析时，不同类别分开做。nodeSize 用于对GO进行过滤，GO最少需要包含10个基因才会对该GO进行...

GO富集分析（上）

① 输入基因集或差异基因集，进行GO富集分析。② 通过可视化图形呈现分析结果，输出图形包括富集气泡图、条形图、圈图、z-score气泡图（需要Log2(FC)数据）、网络图、二级分类图等。4）文件类型及格式：① 无差异基因列：包含基...

GO富集分析

GO富集是组学数据分析常用的手段，通常用来挖掘差异基因中GO term的富集程度。Fisher's exact test是常用的统计检验方法，但这种方法存在明显的缺点。很多公司提供的测序分析结果都普遍使用这样...

有关富集分析各种表和图怎么看的问题

1、GO富集分析结果以及表头各列的含义如下： GO富集结果表 1）ONTOLOGY：表示GO分类的种类，通常有三个主要的类别： ① BP：生物过程（Biological Process） ② CC：细胞组成（Cellular ...