目前来说java占上风。

.net的当红花旦是c#

一般以c#开发asp.net，winForm以及微软的winPhone程序为主，当然也可以用来开发Windows服务，Unity3D的3D游戏（跨平台，支持ios、android、wp、PSP、xbox等）。而且.net程序只能在windows环境下开发（linux也可以基于mono开发，但不是正途）。

java一般以开发jsp以及android程序为主，其他可以开发一些诸如机顶盒、PDA、冰箱等嵌入式开发（C#也可以做到，但我相信没人用C#做），当然了，java也是可以用来开发winForm程序的，但是个人觉得拿java开发winForm真的是一种折磨，我知道能拿的出手的就只有eclipse以及NetBeans了，其他的我也不是很清楚，对java的了解没C#全面。

语法上来说个人感觉C#可读性更好，同时语法也更加鲜明，个人更加喜欢C#。

开发工具来说VS绝对是全宇宙最好的IDE，而且是公认的，没有之一。

而java一般都是eclipse和NetBeans当然现在还有android studio（开发安卓）了，但是跟VS比都是辣鸡。

市场份额的话java完爆C#几条街。。。而且感觉微软现在发力越来越力不从心了。。