截至2020年7月，黑河市共辖6个行政区，包括1个市辖区、3个县级市、2个县，分别是爱辉区、北安市、五大连池市、嫩江市、孙吴县、逊克县。黑河市人民政府驻爱辉区通江路2号。

市辖区

1.爱辉区

爱辉区，隶属于黑龙江省黑河市，地处黑龙江省东北部，小兴安岭北麓，是黑河市委、市政府的所在地，是黑河市的政治、经济、文化、教育、医疗中心。

爱辉区辖区面积14446平方公里，是我国面向东北亚开放的重要门户，全国首批沿边开放城市。

县级市

2.北安市

北安，黑龙江省辖县级市，由黑河市代管，位于黑龙江省中北部、小兴安岭西南麓，市域总面积7149平方千米。

北安是中国最北部铁路公路交通运输枢纽，滨北线、北黑线、齐北线三条铁路干线，吉黑、伊齐、前嫩、绥北四条高速公路及202国道和332国道在北安交汇。北安素有“北国枪城”、“塞北延安”、“书画之乡”之称，是黑龙江省北部区域中心城市和现代化新兴城市。

3.五大连池市

五大连池市，隶属于黑龙江省黑河市，地处黑龙江省西北部，黑河市西南部，面积9874平方公里。境内著名景点有五大连池风景区，二龙眼泉，泉湖浴场，龙门石寨，地下冰河。

4.嫩江市

嫩江市，隶属于黑龙江省黑河市，所处黑龙江省西北部，黑河市西部，嫩江市因境内的嫩江而得名，总面积15109.2平方千米。

嫩江商贸物流繁荣活跃，已发展成为黑龙江省西北部区域中心城市。 2019年，经国务院批准，民政部批复同意撤销嫩江县，设立县级嫩江市。

县

5.逊克县

逊克县隶属于黑龙江省黑河市，位于黑龙江省北部边疆，距黑河市区165公里。逊克县面积17344平方公里，境内著名景点有沾河漂流、大平台雾凇风景区。

6.孙吴县

孙吴县隶属于黑龙江省黑河市，位于黑龙江省北部、黑河市中部，全县总面积4318.9平方公里。孙吴县距黑河市区106公里，是黑河市重要的交通枢纽。