这俩所学校性质完全不同，学费大大不一样。
琼州学院是三亚市唯一的公办二本大学，今年秋季新生全部在三亚校区报到就学，2009年秋季三亚校区将成为琼州学院的主校区，学校正在筹建7至9个二级学院，学费也超低。学校很有发展潜力，正在高速发展中，仅2008年三亚市就投入几个亿来重点建设，要把琼州学院建设成为“国际化、开放型、特色鲜明的品牌大学”，学校也比较重视与国内外高等学校的文化与学术交流，同加拿大、美国、新加坡、香港、等国家与地区的高校开展包括合作研究、学术互访、互派教师、交换学生等国际合作联合办学关系，以吸引更多的高水平国内外专家学者来校讲学和合作研究，为学生赴海外学习和实践创造更多的机会和更好的条件。2008年获教育部批准成为全国仅有的10个“教育部教育援外基地”之一，建起与国际交流合作接轨的教育平台，为世界发展中国家培训高级人才。
琼州学院简介：http://baike.baidu.com/view/463586.htm

海南大学三亚学院是三本民办谋利的独立院校，学费超高。
读完三本要花十多万，毕业以后是很难拿得回来地，三本跟他的母体学校是没有什么关系的，所以才叫独立学院，都是民办私立院校，说难听点就是挂人家那校名好招生骗人，是不可能在一起上课地，三本有自己独立的校园，中国也没有一个地方认为他这个地方有所好三本过，三本毕业出来在当地用人单位都不敢要。
说句老实话，本科第三批没有所谓“好的三本”，都是挂在名牌大学下来招生办学的民办独立学院，学费超高胃口也非常大，有的在校本三生上几万人，招的学生都是一帮不怎么爱读书的高价富家子弟来集合较多的地方！学习气氛真的不怎么好。学校师资更不行了，招的老师就是请几个退休老师来当名人，剩下的老师大多都是学历不高没什么教学经验的年轻老师。再说毕业后找工作社会认同也不高，用人单位一看你的毕业证就知道你是XX大学XX二级学院的本三生，连去当兵部队都不承认三本学历。
所以读三本还不如读个好点的正规公办二本专科出来好找工作就是这样，特别是家庭条件不富有的孩子。